Cell发布全球城市微生物组图谱 你的住所信息可能就藏在鞋子上

时间:2021-07-06 14:35:03   热度:37.1℃   作者:网络

随着全球城市化进程的不断发展,附着在人类中的细菌、病毒和其他微生物也在交通轨道的通行中频繁的交换,甚至稳定存在,慢慢成为了我们生活的一部分。一些微生物可能具有像COVID-19类似的潜在未知致病性,也有一些微生物与抗微生物药的耐药性相关,还有一些微生物可能具有特定于城市的特征,这些信息的挖掘和发现对于人类的健康发展具有重要意义。这也使得,绘制我们生存所依赖的城市中存在的微生物种类和分布图谱变得更为急需。

近日,来自美国康奈尔医学研究院的研究人员在《Cell》上发表了题为A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance的研究成果,该团队在三年内收集了来自全球32个国家和60个城市的近5,000个样本,通过宏基因组测序,发现了10928种病毒和748种细菌,绘制了全球的城市微生物图谱,并发现了其城市分布特征。

为了更多了解城市中的微生物种群,研究人员从全球60个城市的公共交通系统(栏杆、长凳和售票亭)中共收集了4728个样本,通过宏基因组测序获得了各样本中近12000种微生物数据。基于测序信息,研究人员对微生物物种在全球城市环境中的分布进行了统计分析,发现城市拥有一组“核心”的微生物组,约有1145种微生物基本上出现在所有的样本中,其中31个物种最为保守。此外,最丰富的微生物种类是痤疮角质杆菌,其在所有样品中的丰度分布相对稳定,是一种已知的人类皮肤共生菌。

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