同源重组修复相关(HRR)基因突变谱分析及其在中国食管和胃癌患者中与TMB的关联

时间:2023-06-21 10:55:23   热度:37.1℃   作者:网络

同源重组修复缺陷(HRD)与肿瘤发生有关,可以用以预测PARP抑制剂(PARPi)治疗和免疫治疗的反应。同源重组修复相关 (HRR) 基因的功能丧失或有害突变有助于 HRD 表型。

方法:1237例中国食管癌和胃癌患者的肿瘤组织样本进行551个癌症相关基因测序。基于临床证据,共选择了15个HRR基因(ATM,BRCA1,BRCA2,BARD1,BRIP1,CDK12,CHEK1,CHEK2,FANCL,PALB2,RAD51B,RAD51C,RAD51D,RAD54L,PPP2R2A)。纳入了623名来自TCGA数据集的WES数据的患者进行分析。

结果:在中国队列中,25.1%(62/247)食管癌(EC)患者和20.71%(205/990)胃癌(GC)患者表现出体细胞HRR(sHRR)基因突变。最常见的突变基因是EC中的CHEK2(7%)和GC中的ATM(8%)。48.16%(118/245)EC患者和50.66%(498/983)GC患者中出现胚系HRR(gHRR)基因突变。BRCA2是最常见的突变基因(EC为22%,GC为9%)。4.84%EC患者和4.14%GC患者同时携带胚系和体细胞HRR基因突变。与sHRR-WT患者相比,sHRR-Mut患者的中位TMB更高(EC,8.09 vs 4.41,p < 0.001;GC,8.09 vs 4.26,p < 0.001)。

然而,gHRR-Mut和gHRR-WT患者的中位TMB相似(EC,5.67 vs 5.67,p = 0.903;GC,4.96 vs 4.41,p = 0.356)。在TCGA队列中,15.68%(29/185)EC患者和23.97%(105/438)GC患者表现出sHRR基因突变。最常见的突变基因是ATM(EC为5%,GC为10%)。与sHRR-WT患者相比,sHRR-Mut患者的中位TMB更高(EC,4.78 vs 2.75,p < 0.001;GC,21.23 vs 2.65,p < 0.001)。对于TCGA胃癌队列,与sHRR-WT患者相比,sHRR-Mut患者的中位总生存期明显更好(46.9个月对26.5个月,p = 0.043)。

结论:该研究报道了中国食管癌和胃癌患者HRR基因的遗传景观。体细胞HRR基因突变患者的TMB水平显著升高。在胃癌中,携带体细胞HRR基因突变的患者OS显着延长。

 

参考文献

 DOI: 10.1200/jco.2023.41.16_suppl.e16000

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