Front Oncol:老年急性髓系白血病的转录组学特征将 B7H3 和 BANP 确定为高危患者的良好特征
时间:2022-12-15 14:59:59 热度:37.1℃ 作者:网络
老年人急性髓系白血病(AML)仍然是一个临床挑战,五年总生存率低于10%。目前的ELN 2017遗传风险分类考虑了细胞遗传学和突变特征,将适合AML的患者分为不同的预后组。然而,对于接受非强化治疗的老年患者,这种分类尚未得到验证,在这种情况下,其表现可能欠佳。事实上,老年人AML的转录组景观尚未得到充分探索,它可能有助于对这组患者进行分层。
多中心PETHEMA-FLUGAZA3期临床试验(NCT02319135)共包括283名被诊断为新发或继发性AML的老年患者(>65岁),他们随机接受FLUGA(n = 141),包括3个氟达拉滨和阿糖胞苷诱导周期,然后是6个降低强度FLUGA(riFLUGA)或AZA(n = 142)的巩固周期,3个5-氮杂胞苷诱导周期,然后是6个相同的巩固周期。 诊断为急性早幼粒细胞白血病和ECOG≥4的患者被排除在试验之外。
在中心实验室通过多维流式细胞术对诊断时的骨髓(BM)样本进行表征,并通过FACS纯化白血病细胞。执行共分离方案以获得DNA和RNA。捕获聚-A RNA用于进一步的RNAseq方案,而使用SPRIselect磁珠从聚A捕获上清液中获得DNA.
图:确定老年 AML 患者中超过 12 个月的长生存组。(A)在PETHEMA-FLUGAZA临床试验的AML样本中通过骨髓NGS组合获取RNAseq和突变数据的过程方案。(B) 使用完整的转录分析对整个 AML 患者队列进行无监督分层聚类,识别 3 个不同的组。(C)基于转录谱的3个不同AML组的总生存期分析。
在包括其他不良类别突变(例如 RUNX1、ASXL1 和 FLT3-ITDmt 与 NPM1wt 以及治疗组)的多变量分析中,只有 B7H3 和 BANP 的表达与 OS 。事实上,这 2 个基因将 TP53 突变或复杂核型患者的表达分层为 3 组,具有不同的生存率:B7H3 低表达(CPM 表达 < 1.56 CPM)和高表达 BANP (CPM 表达 > 4.14 CPM)(B7H3lo/BANPhi)的患者转化为显着更好的生存期,而相反的特征显示出非常短的总生存期(B7H3hi/BANPlo)(MOS 1个月与14个月,p < 0.001)。表达谱一致(B7H3lo/BANPlo)、(B7H3hi/BANPhi)的患者预后中等(中位OS分别为3.6个月和3.4个月)。尽管治疗组在多变量分析中没有影响,他们决定通过分别取每个治疗组来确认我们签名的预后价值,确认相同的预后分层。最后,使用BeatAML独立AML患者队列,其中也包括接受强化治疗的老年患者。因此,B7H3的低表达(CPM表达,<1.67 CPM)和高表达BANP(CPM表达>3.96 CPM)似乎确定了TP53突变或复杂核型老年患者经典高风险组(包括接受强化化疗的老年AML患者)中预后更好的患者亚群。
总之,他们对224名同质治疗的老年AML患者进行了RNAseq,目的是确定新的预后组。将B7H3和BANP基因的表达确定为独特的转录组生物标志物,揭示了TP53突变或复杂核型AML患者中的长生存组。TP53突变评估是用NGS进行的,因此没有关于多命中TP53突变的信息。根据他们的研究结果,B7H3lo / BANPhi患者的临床病程更类似于低风险遗传组,并且这种特征可能会减少TP53或复杂核型对AML患者的负面预后影响。这两个基因可以作为预后生物标志物,功能研究应解决其作为AML治疗靶点的效用。
原始出处:
Villar S, Ariceta B, Agirre X, et al. The transcriptomic landscape of elderly acute myeloid leukemia identifies B7H3 and BANP as a favorable signature in high-risk patients. Front Oncol. 2022;12:1054458. Published 2022 Nov 24. doi:10.3389/fonc.2022.1054458