Nature Microbiology:百岁老人肠道病毒组更加多样化,可调节新陈代谢并促进健康寿命!
时间:2023-05-27 19:44:21 热度:37.1℃ 作者:网络
肠道独特的微生物群生态与预防衰老相关疾病有关,因为它可以影响全身免疫功能和对感染的抵抗力。
然而,在生命的不同阶段,肠道微生物组的病毒成分目前仍不清楚。
2023年5月15日,来自麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的Ramnik J. Xavier教授、Simon Rasmussen教授联合Damian R. Plichta 教授在Nature Microbiology杂志发表题为“Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan”的文章。
该研究发现与年轻人(>18 岁)和老年人(>60 岁)的肠道病毒组相比,百岁老人的病毒组更加多样化。
研究人员使用先前发表的来自日本和撒丁岛的 195 个人的宏基因组来描述百岁老人肠道病毒组的特征。
为了描述百岁老人、老年人和年轻人的病毒组结构,研究人员计算并分析了病毒操作分类单位(vOTU)丰度谱。主坐标分析(PCoA)揭示了个体肠道病毒群在年龄梯度上的分离。利用排列多变量方差分析(PERMANOVA),在vOTU丰度谱的基础上,百岁老人的病毒组也与年轻人和老年人有明显的区别。
此外,α -多样性指标也显示,与年轻人和老年人相比,百岁老人病毒组更加多样化和丰富。在vOTU参考数据库的基础上计算丰富度时,观察到病毒组多样性随着年龄的增长而增加。总的来说,这些数据表明百岁老人拥有丰富多样的肠道病毒组。
当在群体水平上总结AMGs的丰度时,发现百岁老人相对于年轻人,蛋氨酸转化为同型半胱氨酸相关的酶的病毒水平差异较高。与细菌编码的同源基因相比,在所有年龄组中,病毒对cysH、metK和mec基因总丰度的贡献平均>7.5%,对dcm基因的贡献平均接近50%。
此外,在每个年龄组中,编码Dcm和CysH AMGs的病毒的患病率都很高。由于病毒体贡献了近50%的dcm基因丰度,试图确定细菌基因组中同源基因的保存情况,发现80%(218/272)被注释为辅助基因,其余为核心细菌基因。总的来说,实验表明这些基因是由与宿主串联扩增的溶原病毒编码的,而不是通过裂解扩增,即百岁老人病毒组支持硫酸盐和同型半胱氨酸代谢。
总的来说,与年轻几十岁的人相比,百岁老人作为一个令人惊讶的健康群体,对年龄相关疾病和感染的易感性降低,他们长寿的原因一直是一个有趣的话题。
本研究描述了日本百岁老人的肠道病毒组,并结合他们独特的微生物特征解剖了他们的生态学,发现百岁老人的人类肠道病毒组更加丰富多样,具有独特的病毒种群。
此外,百岁老人微生物组的噬菌体和细菌成员显示出将甲硫氨酸转化为同型半胱氨酸、将硫酸盐转化为硫化物以及将牛磺酸转化为硫化物的潜力增加,而硫化氢的更大代谢输出又反过来支持粘膜完整性和对病原体的抵抗力。
原始出处:
Johansen, J., Atarashi, K., Arai, Y. et al. Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan. Nat Microbiol (2023). https://doi.org/10.1038/s41564-023-01370-6.