Br J Cancer:乳腺癌循环肿瘤细胞CTC的靶向RNAseq检测与疾病骨转移的相关性分析

时间:2021-07-28 00:00:35   热度:37.1℃   作者:网络

乳腺癌(BC)是一种异质性疾病,其组织病理学和分子特征显著影响患者的临床结局。除最常见的预后因素,如激素受体(HR)的表达和Her-2(人类表皮生长因子受体2)的状态,多基因检测已被证实可用于早期患者的管理和治疗决策。

骨骼是BC最常见的转移部位,但目前尚无相关生物标志物用于预测疾病的骨转移。

在该研究中,研究人员旨在鉴定与循环肿瘤细胞(CTC)中骨转移(BM)发病相关的基因特征,该基因特征通过基于DEPArray的方案从40名转移性BC患者中分离,并根据疾病的转移部位进行分组,即BM组(仅骨转移)、ES组(骨外转移)或BM+ES组(骨骼+骨外转移)。

靶向RNAseq揭示转移位点相关的基因表达谱

研究人员开发了一种靶向RNAseq检测方法来筛选与转移级联反应密切相关的基因。并在具有可变器官性的MDA-MB-231 BC细胞系的亚克隆中验证了一个包含134个基因的集合。

下调基因的功能富集比较分析

研究人员进一步的将该集合数据应用于CTC组,特别是BM组与ES组的比较。研究人员共鉴定了31个差异表达基因,包括MAF、CAPG、GIPC1和IL1B,其在BC中发挥着关键的预后作用。


总而言之,该研究结果显示,CTC是通过靶向RNAseq检测疾病转移研究的合适生物学来源,且在未来的大规模前瞻性研究中或可得到应用。


原始出处:

Lovero, D., D’Oronzo, S., Palmirotta, R. et al. Correlation between targeted RNAseq signature of breast cancer CTCs and onset of bone-only metastases. Br J Cancer (16 July 2021).

 

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